Mechanismy obrany rostlin a jejich kontrola
Marek Petřivalský, Lenka Luhová, Jana Sekaninová, Tereza Jedelská, Martina Bednářová, Daniel Vojtovič
- Role reaktivních forem kyslíku a dusíku v obranných mechanismech rostlin vystavených abiotickým či biotickým stresovým faktorům
- Studium S-nitrosace a denitrosace proteinů v signálních drahách rostlin
- Úloha posttranslačních modifikací proteinových cysteinů v signálních drahách sulfanu během rostlinných odpovědí na stresové faktory
- Funkce oxidu dusnatého v signálních drahách strigolaktonů a karrikinů ve vývoji kořenů rostlin
Výzkum imunity a zdraví včel (Apis mellifera)
Jiří Danihlík, Marek Petřivalský, Silvie Dostálková, Martina Janků, Jana Jemelková, Zuzana Strádalová, Eva Miková, Eliška Beranová, Kristýna Myslínová, Linda Tölgová, Alice Šárková, Vladan Doupovec, Gabriela Hofericová, Eva Hrtánková, Pavel Urva
- Purifikace a kvantifikace antimikrobiálních peptidů včel
- Testování antimikrobiální aktivity peptidů a dalších látek proti různým kmenům bakterií
- Výzkum imunitního systému včel v reakci na patogeny či parazity
- Analýza příčin ztrát včelstev, www.coloss.cz
Genomika luštěnin
Mária Škrabišová, Jana Slivková, Jana Biová, Ivana Kaňovská, Vladan Doupovec
- Sója jako model pro ostatní organismy
- Aplikovaná genomika – transfer metod pro zlepšování nutričních a agronomických vlastností ostatních luštěnin
- Vývoj metody GWAS pro identifikaci genů v organismech s omezeným množstvím a kvalitou genomických dat
- Vývoj bioinformatických nástrojů pro práci s velkými daty:
- SNPViz (http://soykb.org/newSNPViz/),
- AccuTool (http://soykb.org/AccuTool/index.php),
- Soybean Allele Catalog (http://soykb.org/GenescapeAnalysis/search.php),
- Sequence Guide dog (http://soykb.org/GenescapeAnalysis/allele_catalog_tool.php) (Python, Perl, R)
- Transkriptomika, transgenoze, produkce rekombinantních proteinů
Biochemie proteinů a proteomika
Marek Šebela, Michaela Rašková
- Hmotnostní spektrometrie v analýze proteinů - identifikace a kvantifikace proteinů, analýza posttranslačních a chemických modifikací, proteinové profilování
- MALDI hmotnostní spektrometrie buněk mikroorganismů
- Využití MALDI hmotnostní spektrometrie pro měření aktivity enzymů
- Studium enzymů, zejména rostlinného a mikrobiálního původu, např. dehydrogenasy, oxidasy a proteasy
- Studium enzymů zapojených v metabolismu polyaminů
Signální dráhy rostlinných hormonů
- Role alternativního sestřihu v cytokininové signální dráze
- Signální dráhy rostlinných hormonů
- Metabolismus rostlinných hormonů cytokininů
- Molekulární klonování, transgenoze rostlin, mikroskopie