Komerční výzkum

Provádíme pokročilou mikroskopickou analýzu (mikroskopické systémy 2xLightsheet, Airyscan, flipped Airyscan, spinning disk, super-resolution Elyra with SIM and PALM, FRAP, FRET) chemických senzorů a barviv v živých buňkách, 3D imaging buněk, tkání, pletiv, organoidů, včetně návrhu experimentálního designu, super-rezoluční a live-cell imaging včetně dynamiky procesů, „tissue clearing“ a „whole-organ imaging“ na fixovaných vzorcích.

Nabízíme špičkové mikroskopické analýzy pro stanovení ploidie a karyotypu rostlinných linií, stejně jako detekce a detailní analýzy bakteriálních, houbových i symbiotických mikroorganismů. Využíváme pokročilé zobrazovací technologie pro přesnou diagnostiku a podporu šlechtění a ochrany rostlin.

Provádíme specializovanou analýzu buněčných stěn rostlin se zaměřením na celulózu, pektiny, lignin a suberin pomocí pokročilé fluorescenční mikroskopie. Díky moderním zobrazovacím technologiím poskytujeme přesné informace o složení a prostorové organizaci těchto struktur, což podporuje výzkum, šlechtění i hodnocení kvality rostlinných materiálů.

Nabízíme kvantitativní obrazovou analýzu s využitím programů ZEN a Arivis, segmentaci bakterií, buněk, jader a dalších organel, 3D rekonstrukci a volumetrickou analýzu, automatizaci pipeline, vizualizaci 3D dat (data-to-figure), školení a workshopy zaměřené na pokročilou fluorescenční mikroskopii a základy obrazové analýzy v ZENu/Arivisu, segmentaci a kvantifikaci buněčných kompartmentů.

Nabízíme detekci a kvantifikaci abundance rostlinných proteinů specifickými protilátkami pomocí imunoblotování. Provádíme také detekci fosforylace, oxidativních a jiných posttranslačních modifikací proteinů s využitím imunoblotování a imunoafinitní chromatografie. Nabízíme detekci oligomerního stavu proteinu.

Nabízíme komplexní analýzu antioxidačního systému rostlin zaměřenou na klíčové enzymové a neenzymové mechanismy ochrany proti oxidačnímu stresu. Analyzujeme vybrané antioxidační enzymy a nízkomolekulární antioxidanty, které zásadně ovlivňují fyziologickou odpověď rostlin na stresové podmínky.

Nabízíme detekci protein-proteinových interakcí pomocí bimolekulární fluorescenční komplementace (BiFC) a kvasinkového dvouhybridního systému. Zahrnuje dle potřeby také přípravu konstruktů a samotnou analýzu, včetně kvantifikace. Nabízíme také detekci interakcí pomocí ko-imunoprecipitace (podmínkou je dodání transgenních rostlin se značeným proteinem zájmu) v kombinaci s imunoblotováním. Možnost přípravy vzorku pro proteomickou analýzu interaktomu.

Nabízíme komplexní službu zaměřenou na produkci rekombinantních proteinů v bakteriálním expresním systému Escherichia coli. Zajišťujeme celý proces od návrhu expresní strategie až po optimalizaci produkce a purifikaci cílových proteinů. Systém je vhodný pro rychlou a efektivní produkci širokého spektra proteinů pro výzkumné, biochemické i biotechnologické aplikace.

S využitím různých typů DNA markerů provádíme přesnou a spolehlivou selekci rezistentních rostlin v programech šlechtění ječmene.

Provádíme stabilní genetickou transformaci a editaci genů u vojtěšky seté pomocí Agrobacteria a somatické embryogeneze.

S využitím různých typů DNA markerů provádíme přesnou a spolehlivou selekci rostlin v programech šlechtění vojtěšky (produkce a kvalita, resilience a resistence).

Nabízíme možnost dálkového monitoringu a odběru pupenů, listů, stonek, květů, plodů a parazitických rostlin pomocí manévrovatelných dronů pro následné biologické, fytopatologické (bakterie, houby, parazitické rostliny), ekologické (ptactvo a hmyz) a biochemické studie. Možnost doplnění o laboratorní experimenty za využití moderních biochemických, molekulárních a mikroskopických metod. Naše drony jsou navíc vybaveny nastavitelným postřikovým systémem Green Doctor pro velmi přesnou a cílenou aplikaci růstových regulátorů, insekticidů, herbicidů nebo biologické ochrany přímo do korun stromů. Nabízíme také služby letecké fotografie ve vysokém rozlišení pomocí dronů a analýzu obrazu s využitím AI.

Nabízíme část našich pěstitelských a pokusných kapacit pro rostliny kultivované in vivo, in vitro, testování nových kultivarů a odrůd v skleníku, fytotronech a fytokomorách s možností provádět širokou škálu experimentů a na kvantitativní úrovni testovat reakci rostlin na abiotické a biotické stresy (patogenní a beneficiální mikroby), chemické a fyzikální faktory, pesticidy, nebo růstové regulátory a biologicky aktivní látky v kontrolovaných podmínkách.