Granty
Běžící projekty
Experimentální využití mitogenem aktivovaných proteinkinas a moderních mezioborových přístupů pro perspektivní zlepšení odolnosti vojtěšky vůči chladu, suchu a zasolení
2025-2029; MŠMT, program INTER-EXCELLENCE II, podprogram INTER-ACTION – LUAUS25 (BILATERÁLNÍ PROJEKTY ČR-USA); hlavní řešitel Prof. Jozef Šamaj
VIP UP: Rozvoj vzdělávací infrastruktury a inovativních přístupů k výuce na Univerzitě Palackého v Olomouci
2024-2028; ERDF, OP JAK; hlavní řešitelka: Mgr. Gabriela Pokorná (Projektový servis UP)
Odhalení nového mechanismu regulace antioxidační obrany rostlin během solného stresu pomocí protein-proteinových interakcí
2023-2025; Young Researcher Grant Competition 2023, UP Olomouc; hlavní řešitel Dr. Petr Dvořák
Role annexinů ANN1, ANN3 a ANN4 ve vývoji kořenových vlásků Arabidopsis
2025-2026; IGA Studentská grantová souťež UP; hlavní řešitelka Dr. Olga. Šamajová
IQ UP: Moderně a inovativně ke kvalitnímu vzdělání na Univerzitě Palackého v Olomouci
2024-2028; ERDF, OP JAK; hlavní řešitelka: Mgr. Gabriela Pokorná (Projektový servis UP)
Ukončené projekty
Objasnění rolí aktinu, NADP oxidázy a strukturních sterolů ve vrcholovém růstu kořenových vlásků pomocí pokročilé mikroskopie a proteomiky
2019-2023; GAČR; hlavní řešitel prof. J. Šamaj
Studium vývojových rolí superoxid dismutázy FeSOD1 s využitím mezioborových metod
2019-2023; GAČR; hlavní řešitel doc. T. Takáč
Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje
2018-2023; projekt OPVVV; hlavní řešitel prof. I. Frébort, vědecký koordinátor prof. J. Šamaj
Role of MAPK signalling and metabolomic reprograming during Arabidopsis-Xanthomonas interaction
2018-2022; Research Group Linkage Programme, Humboldt Foundation; hlavní řešitel prof. J. Šamaj
Genetické a buněčně biologické studium regulace signalizace YODA (MAP3K4) pomocí HSP90 u huseníčku
2017-2021; GAČR; hlavní řešitel prof. J. Šamaj; projekt hodnocen jako vynikající
Charakterizace organizace mikrotubulů během buněčného dělení, růstu a morfogeneze rostlin pomocí superresoluční mikroskopie
2016-2020; GAČR; hlavní řešitel doc. G. Komis
Funkční regulace fosfolipasy D alfa 1 prostřednictvím MPK3-závislé fosforylace
2016-2018; GAČR; hlavní řešitel prof. J. Šamaj
Studium fosforylace KATANINU1 a štěpění mikrotubulů v huseníčku
2015-2017; GAČR; hlavní řešitel prof. J. Šamaj
Fosforylace a funkční regulace cytoskeletálního proteinu End Binding 1c pomocí mitogen-aktivovaných proteinkináz
2014-2017; GAČR; hlavní řešitel Dr. Kuchařová
Úloha mitogen-aktivovaných protein kináz (MPKs) v odpovědích ječmene na napadení Puccinia hordei
2012-2016; GAČR; hlavní řešitel Dr. Křenek
Stres a signaling u rostlin pomocí mitogen aktivovaných proteinkinas: od základního výzkumu na Arabidopsis k biotechnologickým aplikacím na plodinách
2011-2015; GAČR; hlavní řešitel prof. J. Šamaj; projekt hodnocen jako vynikající
Polarity control and cross-talk between signalling, endomembranes and the cytoskeleton in Arabidopsis root hairs
DFG Project, SA 1564/2-1; hlavní řešitel prof. J. Šamaj; hodnocen jako vynikající
The role and the integration of the cytoskeleton and MAPK signalling during osmotic and heat stress responses of higher plant cells
2006-2008; AvH Project; hlavní řešitel doc. G. Komis
Cold and Salt Stress in plants regulated by endocytosis: from biochemistry and molecular cell biology to biotechnology
2006-2008; DAAD Project “Modern Applications of Biotechnology”; hlavní řešitel doc. T. Takáč
The role of the cytoskeleton and vesicular trafficking in polarity establishement during in vitro embryogenesis and pollen development in Arabidopsis and maize
AvH Project; hlavní řešitel prof. J. Šamaj
Klíčové reference
Sojka J, Šamajová O, Šamaj J (2024) Gene-edited protein kinases and phosphatases in molecular plant breeding. Trends in Plant Science 29, 694-710.
Hlaváčková K, Šamaj J, Ovečka M (2023) Cytoskeleton as a roadmap navigating rhizobia to establish symbiotic root nodulation in legumes. Biotechnology Advances 69, 108263.
Kuběnová L, Haberland J, Dvořák P, Šamaj J, Ovečka M (2023) Spatiotemporal distribution of reactive oxygen species production, delivery, and use in Arabidopsis root hairs. Plant Physiology 193, 2337-2360.
Melicher P, Dvořák P, Řehák J, Šamajová O, Pechan T, Šamaj J, Takáč T (2024) Methyl viologen induced changes in the Arabidopsis proteome implicate PATELLIN 4 in oxidative stress responses. Journal of Experimental Botany 75, 405-421.
Basheer J, Vadovič P, Šamajová O, Melicher P, Komis G, Křenek P, Králová M, Pechan T, Ovečka M, Takáč T, Šamaj J (2022) Knockout of MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 3 causes barley root resistance against Fusarium graminearum. Plant Physiology, 190, 2847–2867.
Kuběnová L, Tichá M, Šamaj J, Ovečka M (2022) ROOT HAIR DEFECTIVE 2 vesicular delivery to the apical plasma membrane domain during Arabidopsis root hair development. Plant Physiology, 188, 1563-1585.
Ovečka M, Sojka J, Tichá M, Komis G, Basheer J, Marchetti C, Šamajová O, Kuběnová L, Šamaj J (2022) Imaging plant cells and organs with light-sheet and super-resolution microscopy. Plant Physiology, 188, 683-702.
Melicher P, Dvořák P, Krasylenko Y, Shapiguzov A, Kangasjärvi J, Šamaj J and Takáč T (2022) Arabidopsis iron superoxide dismutase FSD1 protects against methyl viologen-induced oxidative stress in a copper-dependent manner. Frontiers in Plant Science, 13:823561.
Hrbáčková M, Luptovčiak I, Hlaváčková K, Dvořák P, Tichá M, Šamajová O, Novák D, Bednarz H, Niehaus K, Ovečka M, and Šamaj J (2021) Overexpression of alfalfa SIMK promotes root hair growth, nodule clustering and shoot biomass production. Plant Biotechnology Journal 19, 767-784.
Dvořák P, Krasylenko Y, Ovečka M, Basheer J, Zapletalová V, Šamaj J, Takáč T (2021) In‐vivo light‐sheet microscopy resolves localisation patterns of FSD1, a superoxide dismutase with function in root development and osmoprotection. Plant, Cell & Environment 44, 68-87.
Dvořák P, Krasylenko Y, Zeiner A, Šamaj J, Takáč T (2021) Signaling toward reactive oxygen species-scavenging enzymes in plants. Frontiers in Plant Science 11:618835.
Tichá M, Illésová P, Hrbáčková M, Basheer J, Novák D, Hlaváčková K, Šamajová O, Niehaus K, Ovečka M, Šamaj J (2020) Tissue culture, genetic transformation, interaction with beneficial microbes, and modern bio-imaging techniques in alfalfa research, Critical Reviews in Biotechnology 40, 1265-1280.
Komis G, Šamajová O, Ovečka M, Šamaj J (2018) Cell and developmental biology of plant mitogen-activated protein kinases. Annual Review of Plant Biology 69, 237-265.
Ovečka M, von Wangenheim D, Tomančák P, Šamajová O, Komis G, and Šamaj J (2018) Multiscale imaging of plant development by light-sheet fluorescence microscopy. Nature Plants 4, 639-650.
Komis G, Novák D, Ovečka M, Šamajová O, Šamaj J (2017) Advances in imaging plant cell dynamics. Plant Physiology, published online November 2017, doi: 10.1104/pp.17.00962
Takáč T, Šamajová O, Luptovčiak I, Pechan T, Šamaj J (2017) Feedback microtubule control and microtubule-actin cross-talk in Arabidopsis revealed by integrative proteomic and cell biology analysis of KATANIN 1 mutants. Molecular & Cellular Proteomics 16, 1591-1609
Komis G, Mistrík M, Šamajová O, Ovečka M, Bartek J, Šamaj J (2015) Superresolution live imaging of plant cells using structured illumination microscopy. Nature Protocols 10(8), 1248-63
Ovečka M, Vaškebová L, Komis G, Luptovčiak I, Smertenko A, Šamaj J (2015) Preparation of plants for developmental and cellular imaging by light-sheet microscopy. Nature Protocols 10(8), 1234-47
Komis G, Šamajová O, Ovečka M, Šamaj J (2015) Super-resolution Microscopy in Plant Cell Imaging. Trends in Plant Science, 20(12), 834-843
Komis G, Šamaj J (2014) Plant MAP Kinases. Methods and Protocols. ISBN 978-1-4939-0921-6, Springer, Berlin, Heidelberg, pp. 266
Smékalová V, Luptovčiak I, Komis G, Šamajová O, Ovečka M, Doskočilová A, Takáč T, Vadovič P, Novák O, Pechan T, Ziemann A, Košútová P, Šamaj J (2014) Involvement of YODA and mitogen activated protein kinase 6 in Arabidopsis post-embryogenic root development through auxin up-regulation and cell division plane orientation. New Phytologist 203, 1175-1193
Komis G, Mistrík M, Šamajová O, Doskočilová A, Ovečka M, Illés P, Bártek J, Šamaj J (2014) Dynamics and organization of cortical microtubules as revealed by superresolution structured illumination microscopy. Plant Physiology 165 (1), 129-148
Beck M, Komis G, Müller J, Menzel D, Šamaj J (2010) Arabidopsis homologs of Nucleus- and Phragmoplast-Localized Kinase 2 and 3 and Mitogen-Activated Protein Kinase 4 are essential for microtubule organization. Plant Cell 22(3), 755-771
Müller J, Beck M, Mettbach U, Komis G, Hause G, Menzel D, Šamaj J (2010) Arabidopsis MPK6 is involved in cell division plane control during early root development, and localizes to the pre-prophase band, phragmoplast, trans-Golgi network and plasma membrane. Plant Journal 61, 234-248
Šamaj J , Baluška F, Voigt B, Schlicht M, Volkmann D, Menzel D (2004) Endocytosis, actin cytoskeleton and signaling. Plant Physiology 135, 1150-1161
Šamaj J, Read ND, Volkmann D, Menzel D, Baluška F (2005) The endocytic network in plants. Trends Cell Biol, 15, 425-433
Šamaj J, Müller J, Beck M, Böhm N, Menzel D (2006) Vesicular trafficking, cytoskeleton and signalling in root hairs and pollen tubes. Trends in Plant Science 11, 594-600
Beck M, Komis G, Ziemann A, Menzel D, Šamaj J (2011) Mitogen-activated protein kinase 4 is involved in the regulation 1 of mitotic and cytokinetic microtubule transitions in Arabidopsis thaliana. New Phytologist, 189(4), 1069-1083
Šamaj J , Ovecka M, Hlavacka A, Lecourieux F, Meskiene I, Lichtscheidl I, Lenart P, Salaj J, Volkmann D, Bögre L, Baluška F, Hirt H (2002) Involvement of the mitogen-activated protein kinase SIMK in regulation of root hair tip-growth. EMBO J. 21, 3296-3306