Doktorské studium

Vysoká škola: Univerzita Palackého
Součást vysoké školy: Přírodovědecká fakulta
Název studijního programu: Biologie
Název studijního oboru: Botanika
Délka studia (roky): 4
Garant DSP Botanika a předseda Oborové rady: prof. RNDr. Aloisie Poulíčková, CSc.
Garantující pracoviště: Katedra botaniky

Anotace

Program je určen studentům, kteří chtějí získat hluboké znalosti a praktické zkušenosti nezbytné ke studiu a pochopení struktury a funkce nižších a vyšších rostlin na všech úrovních biologické organizace. Obor je maximálně otevřený a má interdisciplinární povahu s tím, že klasické botanické přístupy jsou kombinovány s přístupy jiných disciplín (mikrobiologie, fyziologie, molekulární biologie, biofyzika, genetika, populační biologie, ekologie). Tento přístup poskytuje vysokou adaptabilitu absolventů a možnost jejich dobrého uplatnění v praxi.

Charakteristika oboru

Doktorský studijní program (DSP) Botanika je určen absolventům navazujícího magisterského studia Botanika a dalších příbuzných biologických oborů. Studenti mohou dle zaměření své disertační práce využívat špičkově vybavené laboratoře, prostory pro kultivaci rostlin a specializované bioinformatické a statistické nástroje. Katedra botaniky spolupracuje s řadou pracovišť v ČR i v zahraničí, kde mohou studenti uskutečnit své stáže.

Profil absolventa

Absolvent získá široké znalosti v oblasti tzv. Plant Sciences, včetně současných trendů a metodických postupů, které jsou v této oblasti uplatňovány. Základem jeho profilu budou zkušenosti s plánováním vědecké a výzkumné práce, sběrem terénních a experimentálních dat, analýza a zpracování výsledků, jejich teoretická a praktická interpretace, zpracování vědeckých a odborných publikací, včetně prezentací na konferencích.

Podle konkrétního zaměření studia zvládne potřebné laboratorní i terénní metody používané v rostlinných vědách. Prohloubí svoje znalosti ve využívání informačních technologií používaných ve vědecké práci, přístup k elektronickým databázím, zpracování elektronických grafických prezentací. Získá velmi dobré jazykové znalosti umožňující aktivní komunikaci a prezentaci výsledků ve studovaném oboru.


Absolventi studia mají široké možnosti uplatnění na vysokých školách, ve vědeckých a výzkumných ústavech v ČR a zahraničí, jež jsou orientovány na biologickou problematiku. Velmi dobře se mohou uplatnit ve státních i soukromých organizacích, jako jsou např. referáty životního prostředí, ochrana přírody, ekologické organizace, muzea, správy chráněných území a národních parků, hygienická služba, zemědělské a šlechtitelské organizace, firmy orientované na ekologickou problematiku a hodnocení stavu životního prostředí.

Požadavky k přijímacím zkouškám

Uchazeč musí být absolventem magisterského studia přírodovědného směru univerzity nebo jiné (např. technické) vysoké školy s biologickým či biochemickým zaměřením. Musí prokázat odborné znalosti a předpoklady pro samostatnou vědeckou práci v oboru a znalost anglického jazyka.

Uchazeč se hlásí na dopředu vypsané téma (obvykle po předchozí konzultaci s potenciálním školitelem), viz přehled témat disertačních prací pro příslušný akademický rok, který naleznete zde.


Znalosti uchazeče jsou prověřeny formou vstupního pohovoru, který je součástí přijímacího řízení. Uchazeč by měl uvést svou představu a motivaci ke studiu dané problematiky.

Zápis

Přijatý uchazeč dodá na studijní oddělení (referentka Z. Bednářová) dokumety z e-přihlášky (zápisový list, GDPR, BOZP, případně ověřenou kopii diplomu u absolventů mimo UP). Studijní referentka zavede studenta do systému a od 1.9. studenta automaticky zapíše ke studiu. V případě dřívějšího zápisu je nutná žádost podepsaná školitelem a garantem DSP.

Studijní plán

Po přijetí student se svým školitelem sestaví studijní plán, který poskládá ze studijních předmětů tak, aby splnil povinné předměty, vybral si z povinně volitelných a volitelných předmětů a získal předepsaný počet kreditů. Studijní plán musí schválit garant DSP Botanika a poté jej student odevzdá studijní referentce pro DSP. Závažné změny ve studijním plánu v průběhu studia (změna tématu disertace, přerušení studia, prodloužení studia 4+) je třeba ošetřit žádostí, schválenou garantem DSP (formuláře na webu). O drobné změny, např. zapsání zkoušky v jiném ročníku, než bylo plánováno se průběžně žádat nemusí. Případně se soubor drobných změn předloží při závěrečném hodnocení studia. Do 30.6. musí každý student odevzdat na studijním odd. hodnocení akademického roku (formulář na webu). Formulář student předvyplní a školitel přidá krátké hodnocení, zda doporučuje/nedoporučuje pokračovat ve studiu, schvaluje garant DSP.  Ke konci každého akademického roku probíhá hodnocení studentů Oborovou radou, které musí garant předpřipravit, proto si některé údaje o zkouškách a stážích může vyžádat od studenta dříve. Ke stejnému datu (30.6.) podává student, který prodlužuje (4+) žádost o prodloužení studia. V průběhu roku možná dojde ke změnám, protože se připravuje digitalizace hodnocení studentů.

Studijní předměty

Před zahájením každého semestru, kdy poradce pro STAG na katedře (Botanika - doc. P. Hašler) otevírá ve STAGU předměty, je třeba mu nahlásit, které předměty si v semestru hodlá student zapsat. Poradce otevře pro doktorandy jen ty předměty, o které je v daném semestru zájem. Po otevření předmětu se student zapíše. Po jeho splnění vyplní formulář „Záznam o zkoušce“, předloží k podpisu školiteli a garantovi a odevzdá na studijním. Garant předmětu/oboru zapíše zkoušku do STAGU. V následujícím textu je uvedeno kdo konkrétní předměty zapisuje.


Pozor: formulář je obecný, je třeba ho upravit pro danou konkrétní situaci. Např. v kolonce „podpis školitele“ nebo „podpis garanta“ je třeba vyplnit jeho jméno. Pokud je zkouška komisionální, vyplní se jména zkoušejících.

A) Povinné předměty (140 kreditů)

  • Odborný seminář 1 & 2 (probíhá 2x ročně cca v březnu a listopadu, organizuje prof. A. Lebeda, jde o úvodní a závěrečnou prezentaci studenta k disertaci)
  • Prezentace na konferenci
  • Vědecko-výzkumná stáž 1 (po dohodě se školitelem je třeba vyřídit u příslušné referentky pro zahraniční stáže Mgr. Marie Raková), stáž musí souviset s tématem disertace a student si přiveze potvrzení, že na daném zahraničním pracovišti skutečně stáž absolvoval
  • Disertační práce 1–6 (splnění se uděluje za to, že student v semestru pracuje v terénu či laboratoři a průběžně se školitelem konzultuje co udělal)

V případě předmětů A podepisuje „Záznam o zkoušce“ školitel a garant DSP, do STAGU zapisuje garant DSP Botanika. U stáže se do formuláře vyplní místo, čas a kratičká charakteristika co tam dotyčný dělal (sběr vzorků v terénu, izolace DNA …).

Pozn.: Zcela výjimečně, na základě žádosti panu děkanovi, může být povinná stáž nahrazena např. další publikací nad rámec disertace, pokud jsou k tomu závažné zdravotní či osobní důvody, např. mateřství. Doporučuji naplánovat stáž a sběr dat v terénu co nejdříve, člověk nikdy neví.

B1) Povinně volitelné předměty – jazyková průprava (15 kreditů)

  • Anglický jazyk pro doktorské studium (VCJ/PGAJ)
  • Vědecko-výzkumná stáž 2
  • Odborný seminář v AJ (prezentace k tématu disertace v AJ v rámci odborných seminářů prof. A. Lebedy viz výše)
  • Přednáška v Aj na mezinárodní konferenci

VCJ/PGAJ do STAGU zapisuje garant předmětu, ostatní zapisuje garant DSP Botanika

B2) Povinně volitelné předměty – oborové (20 kreditů)

  • Odborný předmět 1
  • Pedagogická činnost 1(BOT/PGPC1)
  • Molekulární a buněčná biologie
  • Ekologie rostlin
  • Proměnlivost a evoluce rostlin
  • Fytopatologie
  • Obecná botanika
  • Obecná genetika
  • Obecná mykologie
  • Fyziologie a biochemie rostlin
  • Algologie speciální
  • Systém a evoluce rostlin
  • Technika explantátových kultur
  • Mikrobiologie a virologie
  • Věda o vegetaci
  • Management vědy a výzkumu

Oborové předměty zkouší komise (min. 2 zkoušející). Obvykle garant předmětu + někdo z katedry, kdo má k problematice blízko, případně školitel studenta, nebo garant DSP. Odborný předmět 1(BOT/PGOP1) funguje jako „Joker“, lze za něj dosadit předmět, který není ve výběru. Garantem předmětu je garant DSP a ke zkoušení si přibere odborníka na daný předmět, který může být z jiné katedry i pracoviště a nemusí být Doc. (např. z UEB, AVČR atd.). Např. algologové si často brali hydrochemii, zkoušel pracovník Katedry Ekologie. Dalšími možnostmi jsou třeba biochemie, biofyzika atd. dle zaměření disertanta. Oborové předměty do STAGU zapisuje garant příslušného předmětu, BOT/PGPC1 a BOT/PGOP1 zapisuje garant DSP Botanika.

Důrazné doporučení: zařaďte prosím do plánu 3 odborné botanické zkoušky z výše uvedeného seznamu. Zejména studenti, kteří nejsou absolventy NMgr. Botanika, ale přišli z Mgr. oboru biochemie, molekulární biologie atd. nechť si touto formou doplní obecné botanické vzdělání jako obecná botanika, obecná mykologie, systém, ekologie.

B3) Povinně volitelné předměty – publikační činnost (40 kreditů)

  • Hlavní autor publikace s IF
  • Hlavní autor publikace v recenzovaném časopise 1
  • Spoluautorství v časopise s IF 1

B4) Povinně volitelné předměty (10 kreditů)

  • Rešerše k disertační práci (cca 10 stran, odevzdává se garantovi DSP v českém/slovenském či anglickém jazyce, vzor pro vypracování na vyžádání u garanta DSP)
  • Teze k disertační práci (cca 5 stran, odevzdává se garantovi DSP, v českém/slovenském či anglickém jazyce, vzor u garanta DSP)
  • Hlavní autor publikace s IF 2

C) Volitelné předměty

  • Popularizační aktivity na UP (např. Noc vědců)
  • Hlavní autor publikace s IF 3
  • Hlavní autor publikace v recenzovaném časopise 2
  • Spoluautorství v časopise s IF 2
  • Projektová činnost
  • Pedagogická činnost 2 & 3 (sem patří výuka cvičení, seminářů, vedení bakalářských prací)
  • Odborný předmět 2 & 3

Předměty B3 & B4 a C zapisuje do STAGU garant DSP Botanika, záznam o zkoušce podepisuje nejdřív školitel, poté garant DSP. U publikačních výstupů se vypisuje celá citace článku a IF časopisu.

D) Státní doktorská zkouška (SDZ)

Týká se jen studentů s nástupem do 1.9. 2025.

Student sdělí školiteli, že se hodlá přihlásit k SDZ a školitel spolu s garantem DSP Botanika naplánuje přibližný termín a složení komise. Student sám nikoho v této věci nekontaktuje, pouze školitele.

K SDZ se student musí písemně přihlásit minimálně 2 měsíce před plánovaným termínem. S přihláškou odevzdá anotaci disertace (cca 1 strana, cca 6 ks dle předpokládaného počtu členů komise + 1ks k archivaci). Musí mít splněny zkoušky A a B (nemusí být splněna publikační činnost, minimum 180 kreditů).

Garant DSP Botanika sestaví komisi „na míru“ dle konkrétního tématu disertace z odborníků z ČR/SR a po schválení panem děkanem stanoví termín SDZ. SDZ probíhá před touto komisí, student je představen předsedou komise, pronese 10 min. anotaci o tématu své disertace a dále je zkoušen ze 3 odborných oborových předmětů, které absolvoval v průběhu studia (předměty B2, viz důrazné doporučení).

Další podmínky studia

Pedagogická činnost – studenti by se měli dle možností zapojit do výuky v rámci PGPC1-3 formou cvičení, seminářů pro studenty, případně vedením Bc. prací
Zahraniční stáž – v trvání minimálně 1 měsíce bez přerušení v rámci povinného předmětu A (referentka Mgr. Marie Raková).
Publikační činnost – min. 2 prvoautorské vědecké články na téma disertace v impaktovaných časopisech (podrobnější pravidla podle formy disertace a nástupu ke studiu viz příslušný zkušební řád, liší se pro studenty s nástupem před a po 1. 9. 2025). Každý student se řídí pravidly, která platila v době jeho nástupu do studia.
Zapojení do grantových projektů – student může být zapojen do výzkumné problematiky a projektů svého školitele. Může si v průběhu studia podat vlastní grant dle aktuální nabídky. Student je rovněž zapojen do projektu PrF-IGA (řešitel Prof. A. Poulíčková) a je povinen do publikací i disertační práce dát dedikaci příslušných jednoletých IGA projektů. Po dohodě se školitelem může z IGA čerpat peníze na materiál v rámci budgetu pracovní skupiny. Dostane motivační jednorázové stipendium, případně doktorské stipendium (pokud není zařazen do projektu svého školitele).
Stipendium – student prezenčního DSP dostává po 4 roky svého studia doktorský studijní příjem dle aktuálního platného předpisu (od 1. 9. 2025 je to 1,2 - násobek minimální mzdy pro studenty kteří nastoupili do 1. ročníku; každý rok se odvíjí od minimální mzdy platné k 1.7. před zahájením školního roku). Příjem se skládá z různých zdrojů, část je základní stipendium z PřF, doplatek do minimálního příjmu pak zajistí katedra (z projektů školitelů či IGA). Student, který nestačí obhájit v průběhu 4 let (4+) si musí požádat o prodloužení studia, nemá však již nárok na stipendium. Prodloužit studium je možné i jeho přerušením (např. mateřská, doba přerušení se do doby studia nepočítá). Tyto formální záležitosti je nejlepší řešit na studijním oddělení, kde jsou referentky se všemi pravidly obeznámeny.
Zkoušky – student je povinen v souladu se studijním plánem složit předepsané zkoušky (viz výše). 

Obhajoba disertace

Před plánováním obhajoby je třeba požádat písemně o uznání publikační činnosti (žádost na webu). Po uznání publikační činnosti student sdělí školiteli, že je připraven odevzdat práci. Dále už jedná školitel s garantem DSP Botanika, předběžně naplánují termín obhajoby a student minimálně 3 měsíce před plánovaným termínem odevzdá práci. Disertace se odevzdává v tištěné i elektronické verzi, obvykle v počtu podle počtu oponentů kteří si přejí tištěnou verzi + 1 pro archivaci. Dále odevzdá autoreferát max 10 ks (dle počtu členů komise, oponentů + 1 k archivaci). Dále odevzdá písemnou přihlášku (formulář na webu), uznání publikační činnosti, vyjádření školitele na samostatném dokumentu A4. Musí mít splněno 240 kreditů.

Studenti s nástupem 1. 9. 2025 v některých případech nemusí odevzdávat autoreferát (viz nová norma PřF-A-19/01-ÚZ02).

Garant DSP navrhne oponenty, komisi a termín obhajoby (samozřejmě po dohodě se školitelem a potenciálními členy komise, aby jim termín vyhovoval), po jejím schválení panem děkanem je práce studijním oddělením zaslána k posouzení oponentům. Ti musí mít minimálně 6 týdnů na vypracování posudku. Oponenti jsou minimálně dva. Pokud je jeden oponent ze zahraničí, musí být disertace anglicky.

Disertace může mít klasickou podobu kvalifikační práce (podobně jako diplomová práce – cíle, materiál, výsledky, diskuse, literatura), nebo podobu souboru publikací s úvodem a závěrem,  v jazyce českém/slovenském či anglickém. Pro studenty, kteří nastoupili studium po 1. 9. 2025 platí nové ustanovení PřF-A-19/01-ÚZ02. Tedy k předložení souboru článků je nutné mít nejméně 4 původní vědecké práce vyšlé nebo přijaté do tisku (podrobnosti viz citované ustanovení). V předchozí normě nebyl počet publikací pro tuto formu disertace specifikován.

Obhajoba probíhá před komisí a po představení uchazeče začíná prezentací práce studentem. Poté jsou předneseny posudky: posudek školitele, stanovisko školícího pracoviště (vypracovává garant DSP), posudky oponentů. Student odpovídá na dotazy oponentů a následuje veřejná rozprava, kdy se přítomní odborníci a kolegové ptají a student odpovídá. Poté komise v neveřejné části obhajoby vyhodnotí práci, proběhne tajné hlasování a skrutátor sečte hlasy. Student je seznámen s výsledkem. Pokud je jeden z oponentů cizinec a je přítomen fyzicky nebo připojen on-line, probíhá celá obhajoba v angličtině. Finální rozhodnutí o udělení titulu má pan děkan.

Nastavení cookies a ochrany soukromí

Na našich webových stránkách používáme soubory cookies a případné další síťové identifikátory, které mohou obsahovat osobní údaje (např. jak procházíte naše stránky). My a někteří poskytovatelé námi využívaných služeb, máme k těmto údajům ve Vašem zařízení přístup nebo je ukládáme. Tyto údaje nám pomáhají provozovat a zlepšovat naše služby. Pro některé účely zpracování takto získaných údajů je vyžadován Váš souhlas. Svůj souhlas můžete kdykoliv změnit nebo odvolat (odkaz najdete v patě stránek).

(Technické cookies nezbytné pro fungování stránek. Neobsahují žádné identifikační údaje.)
(Slouží ke statistickým účelům - měření a analýze návštěvnosti. Sbírají pouze anonymní data.)
(Jsou určeny pro propagační účely, měření úspěšnosti propagačních kampaní apod.)