Náš výzkumný tým publikoval v květnu 2026 studii zaměřenou na hlavní proteázu (Mpro) viru SARS-CoV-2, která představuje jeden z klíčových enzymů nezbytných pro replikaci koronavirů. V rámci právě ukončeného projektu LEAD GAČR jsme využili high-throughput krystalografický screening rozsáhlé kolekce malých molekul a identifikovali nový typ pyrazolo[1,5-a]pyrimidinového ligandu vážícího se do aktivního místa proteázy. Následná strukturní analýza umožnila detailně popsat interakce v jednotlivých vazebných kapsách enzymu (S1/S2) a využít tyto informace pro racionální návrh nových analogů s vyšší afinitou k virovému proteinu.
Studie vznikla ve spolupráci s pracovišti Macromolecular Crystallography v Helmholtz-Zentrum Berlin a Medical University of Innsbruck. Projekt propojil proteinovou biochemii, rentgenovou krystalografii, návrh malých molekul, biofyzikální metody i výpočetní modelování molekulárních interakcí. Výsledky přispívají k hlubšímu porozumění rozpoznávání ligandů u koronavirových proteáz a zároveň ukazují, jak lze kombinací experimentálních a výpočetních přístupů efektivně navrhovat nové bioaktivní sloučeniny.
Int J Biol Macromol. 2026 May 12:152401.
https://doi.org/doi: 10.1016/j.ijbiomac.2026.152401