1. ROČNÍK
Mgr. Jiří Hrubý Téma: Mimikry mikrobiálních metabolitů ve střevním zdraví prostřednictvím pregnanového X receptoru |
Curriculum Vitae:
2017 - 2020
Bakalářské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
2020 - 2022
Navazující magisterské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
2022 - dosud
Doktorské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
Publikační činnost
Zahraniční pobyty a stáže
2. ROČNÍK
Mgr. Lucia Sládeková Téma: Střevní mikrobiální metabolity jako modulátory signální dráhy aryl uhlovodíkového receptoru |
Curriculum Vitae:
2016 - 2019
Bakalářské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
2019 - 2021
Navazující magisterské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
2021 - dosud
Doktorské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie
Zahraniční pobyty a stáže
Mgr. Šimon Pavlů Téma: Identifikace a analýza regulačních elementů kontrolujících transkripci v genomu ječmene |
Curriculum Vitae:
Publikační činnost
Zahraniční pobyty a stáže
3. ROČNÍK
Mgr. Zuzana Korchanová Téma: Identifikace, charakterizace a funkční validace genů zapojených do interakcí hostitele a patogenu padlí travní u obilovin |
Curriculum Vitae:
Publikační činnost
Korchanová, Z., Švec, M., Janáková, E., Lampar, A., Majka, M., Holušová, K., Bonchev, G., Juračka, J., Cápal, P., Valárik, M. (2022) Identification, high-density mapping, and characterization of new major powdery mildew resistance loci from the emmer wheat landrace GZ1. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 13 897697
Zahraniční pobyty a stáže
Mgr. Adam Lampar Téma: Identifikace, charakterizace a funkční validace regulačních elementů promotorů u obilovin |
Curriculum Vitae:
Publikační činnost
Zahraniční pobyty a stáže
Curriculum Vitae:
Publikační činnost
Zahraniční pobyty a stáže
4. ROČNÍK
Mgr. Eliška Zgarbová Téma: Imunodulační účinky xenobiotik aktivujících aryluhlovodíkový receptor (AhR) Školitel doc. Ing. Radim vrzal, Ph.D. (KBBG) |
Curriculum Vitae:
2014 - 2017 Bakalářské studium, PřF UPOL, Katedra biochemie, obor Biotechnologie a genové inženýrství |
2017 - 2019 Navazující magisterské studium, PřF UPOL, Katedra biochemie, obor Biotechnologie a genové inženýrství |
2019 - dosud Doktorské studium, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie |
Publikační činnost:
Zahraniční pobyty a stáže:
Řešené projekty:
Mgr. Kateřina Kaduchová Téma: Analýza dynamiky a 3D organizace jaderného genomu u ječmene setého (Hordeum vulgare) |
Curriculum Vitae:
Education and Academic Degrees
- 2019–present – Ph.D. studies, Palacky University, Dept. of Biology, Olomouc, Czech Republic.
- 2017–2019 – M.Sc., Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Olomouc, Czech Republic.
- 2013–2017 – Bc., Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Olomouc, Czech Republic.
Research Focus
Hordeum vulgare, marker lines, nuclear organisation, cloning
Awards
CPNW2021 - Best poster award
Publikační činnost
Perutka, Z.; Kaduchova, K.; Chamrad, I.; Beinhauer, J.; Lenobel, R.; Petrovska, B.; Bergougnoux, V.; Vrana, J.; Pecinka, A.; Dolezel, J.; Sebela, M., Proteome Analysis of Condensed Barley Mitotic Chromosomes. Front Plant Sci 2021, 12, 723674.
Zahraniční pobyty a stáže
„Towards in vivo analysis of chromatin dynamics in barley“; 3rd COST-SEB meeting Impact of chromatin domains on plant phenotypes meeting (8. - 12. 12. 2019, San Lorenzo de El Escorial, Spain).
Conference lecture: „In planta live microscopy of barley fluorescent marker lines“ a účast na online workshopu: „Training school on IMARIS-based 3D image processing and analysis of the 3D nucleus“ (7. - 11. 12. 2020, Zurich, Švýcarsko).
Mgr. Lucie Hloušková (Šimková) Téma: Analýza genových oblastí B chromozomů rostlin |
Curriculum Vitae:
Education and Academic Degrees
- 2019 – present – Ph.D. student, Cell and molecular biology, Faculty of Sciences, Palacký University, Olomouc, Topic of Ph.D. thesis: Analysis of gene domains in B chromosomes
- 2017-2019 - Mgr. (M.Sc.), Bioinformatics, Faculty of Sciences, Palacký University, Olomouc, Topic of master thesis: Comparative analysis of Pachycladon exilis subgenomes
- 2013-2017 - Bc., Bioinformatics, Faculty of Sciences, Palacký University, Olomouc, Topic of bachelor thesis: Processing of database informations about plant superoxide dismutases by using bioinformatics methods
Position and Employment
- 2019 - present - Ph.D. student, Centre of structural and functional genomics, IEB AS CR, Olomouc
Research Focus
- Maize B chromosomes
- Bioinformatics
Publikační činnost
Nicolas Blavet, Hua Yang, Handong Su, Pavel Solanský, Ryan N. Douglas, Miroslava Karafiátová, Lucie Šimková, Jing Zhang, Yalin Liu, Jie Hou, Xiaowen Shi, Chen Chen, Mohamed El-Walid, Morgan E. McCaw, Patrice S. Albert, Zhi Gao, Changzeng Zhao, Gil Ben-Zvi, Lior Glick, Guy Kol, Jinghua Shi, Jan Vrána, Hana Šimková, Jonathan C. Lamb, Kathleen Newton, R. Kelly Dawe, Jaroslav Doležel, Tieming Ji, Kobi Baruch, Jianlin Cheng, Fangpu Han, James A. Birchler, Jan Bartoš (2021): Sequence of the supernumerary B chromosome of maize provides insight into its drive mechanism and evolution. Proceedings of the National Academy of Sciences Jun 2021, 118 (23) e2104254118; DOI: 10.1073/pnas.2104254118
Zahraniční pobyty a stáže
5. ROČNÍK
Mgr. Martin Kovačik Téma: Analýza organizace a dynamiky buněčných jader v endospermu ječmene |
Curriculum Vitae:
Kovacik, M.; Nowicka, A.; Pecinka, A., Isolation of High Purity Tissues from Developing Barley Seeds. J Vis Exp 2020, (164).
Nowicka, A.; Kovacik, M.; Tokarz, B.; Vrana, J.; Zhang, Y.; Weigt, D.; Dolezel, J.; Pecinka, A., Dynamics of endoreduplication in developing barley seeds. J Exp Bot 2021, 72, (2), 268-282.
Nowicka, A.; Sahu, P. P.; Kovacik, M.; Weigt, D.; Tokarz, B.; Krugman, T.; Pecinka, A., Endopolyploidy Variation in Wild Barley Seeds across Environmental Gradients in Israel. Genes (Basel) 2021, 12, (5).
Publikační činnost
Zahraniční pobyty a stáže
6. ROČNÍK
Mgr. Karolína Ondrová (Poulíková) Téma: Interakce nutraceutik s regulačními drahami metabolismu xenobiotik Školitel prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (KBBG) |
Curriculum Vitae:
2012 - 2015 | Bakalářské studium, PřF UP, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie |
2015 - 2017 | Navazující magisterské studium, PřF UP, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie |
2017 - dosud | Doktorské studium, PřF UP, Katedra buněčné biologie a genetiky, obor Molekulární a buněčná biologie |
Výzkumné aktivity:
Zahraniční pobyty a stáže:
- Leibniz-institut für umweltmedizinische forschung (IUF; Düsseldorf, Německo) pod vedením dr. Thomase Haarmanna-Stemmanna. Leden - březen 2017.
Řešené projekty:
Absolventi doktorkého studijního programu
Mgr. Klára Procházková, Ph.D. Téma: Identifikace genů podílejících se na opravách toxických DNA-proteinových vazeb u huseníčku rolního (2023) Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR | |
| Mgr. Beáta Strejčková, Ph.D. Téma: Funkční analýza genů ovlivňujících kvetení u obilovin (2023) Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR |
Mgr. Barbora Vyhlídalová, Ph.D. Téma: Endogenní a xenobiotické indoly jako modulátory signálních drah AhR a PXR (2022) Po dokončení doktorského studia působí jako vědecký pracovník na Katedře buněčné biologie a genetiky UPOL | |
| Fen Yang, Ph.D. Téma: Understanding functions of STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOMES 5/6 complex in seed developmet (2021) Po ukončení doktorského studia získala fellowship pro podporu perspektivních lidských zdrojů (PPPLZ) Akademie věd České republiky a působí jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR |
| Mgr. Jana Zwyrtková, Ph.D. Téma: Komparativní analýza genomů vybraných zástupců Poaceae (2021) Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR |
Mgr. Radim Svačina, Ph.D. Fyzické mapování Ph2 regionu u pšenice seté (2021) Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR | |
| Mgr. Šárka Mascaretti, Ph.D. Vztah struktury a účinku chemoterapeutik na bakteriálních filmech a screeningu dynamiky antimikrobiálního účinku Po dokončení doktorského studia působí jako koordinátor podpory QPPV ve společnosti Zentiva |
| Mgr. Alžběta Němečková, Ph.D. Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR |
| Mgr. Ondřej Ženata, Ph.D Studium regulace transkripční aktivity receptoru pro vitamín D (2019) Po ukončení doktorského studia působí jako obchodní zástupce společnosti Avantor Sciences |
| Mgr. Eva Janáková, Ph.D. Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR |
Mgr. Zuzana Tulpová Ph.D Po ukončení doktorského studia pracuje jako postdoktorand v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR | |
Elodie REY, Ph.D. Reakce rostlinného genomu na přenos chromozómů (2018) Školitel: prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. (ÚEB) | |
Moses Nyine Genomic Selection to Accelerate Banana Breeding: Genotyping by Sequencing of Banana Hybrids (2018) Školitel: prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. (ÚEB) | |
Mgr. Kateřina Kubešová, DiS. Ph.D. Po ukončení doktorského studia pracuje jako vedoucí ve společnosti AeskuLab | |
Mgr. Iveta Bartoňková, Ph.D. Po ukončení doktorského studia pracuje jako odborný asistent na katedře buněčné biologie a genetiky, UPOL | |
Mgr. Martina Štěpánková, Ph.D. Enantiospecifické interakce mezi klinicky užívanými chirálními léčivy a regulačními drahami humánních cytochromů P450 (2017) Školitel: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (KBBG) | |
Mgr. Petr CÁPAL, Ph.D. Po ukončení doktorského studia pracuje jako vedoucí výzkumné skupiny v Centru stukturní a funkční genomiky Ústavu experimentální botaniky AV ČR | |
Mgr. Alžběta Srovnalová Ph.D In vitro účinky potravinových složek na signální dráhu aryluhlovodíkový receptor-CYP1A1 (2014) Školitel: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (KBBG) |